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Tarrés-Freixas, FerranAutor o CoautorKochanowski, KarlAutor o CoautorVergara-Alert, JuliaAutor o CoautorSegales, JoaquimAutor o Coautor

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17 de febrero de 2025
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Artículo
Sí

Targeting eEF1A reprograms translation and uncovers broad-spectrum antivirals against cap or m6A protein synthesis routes

Publicado en: Nature Communications. 16 (1): 1087- - 2025-02-07 16(1), DOI: 10.1038/s41467-025-56151-y

Autores: Molina, Elisa Molina; Bech-Serra, Joan Josep; Franco-Trepat, Eloi; Jarne, Ignasi; Perez-Zsolt, Daniel; Badia, Roger; Riveira-Munoz, Eva; Garcia-Vidal, Edurne; Revilla, Lluis; Franco, Sandra; Tarres-Freixas, Ferran; Roca, Nuria; Ceada, Gerardo; Kochanowski, Karl; Raich-Regue, Dalia; Erkizia, Itziar; Boreika, Rytis; Bordoy, Antoni E; Soler, Laia; Guil, Sonia; Carrillo, Jorge; Blanco, Julia; Martinez, Miguel angel; Paredes, Roger; Losada, Alejandro; Aviles, Pablo; Cuevas, Carmen; Vergara-Alert, Julia; Segales, Joaquim; Clotet, Bonaventura; Ballana, Ester; de la Torre, Carolina; Izquierdo-Useros, Nuria

Afiliaciones

Campus Univ Autonoma Barcelona UAB, Ctr Recerca Sanitat Anim CReSA, IRTA, Anim Hlth, Bellaterra 08193, Catalonia, Spain - Autor o Coautor
Campus Univ Autonoma Barcelona UAB, Ctr Recerca Sanitat Anim CReSA, Unitat Mixta Invest IRTA UAB Sanitat Anim, Bellaterra, Catalonia, Spain - Autor o Coautor
Case Western Reserve Univ, Ctr Global Hlth & Dis, Sch Med, Dept Pathol, Cleveland, OH 44106 USA - Autor o Coautor
Germans Trias i Pujol Univ Hosp, Infect Dis Dept, Badalona, Catalonia, Spain - Autor o Coautor
Germans Trias Pujol Res Inst & Hosp IGTP, Microbiol Dept, Badalona, Spain - Autor o Coautor
Inst Salud Carlos III, CIBER Enfermedades Infecciosas CIBERINFEC, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Josep Carreras Leukaemia Res IJC, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Josep Carreras Leukaemia Res Inst IJC, Prote Unit, Badalona, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
PharmaMar SA, Colmenar Viejo, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Sanitat Animal. Producció Animal - Autor o Coautor
Univ Autonoma Barcelona, Fac Vet, Dept Sanitat & Anat Anim, Bellaterra, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Barcelona, Germans Trias & Pujol Res Inst IGTP, Badalona 08916, Spain - Autor o Coautor
Univ Vic Cent Univ Catalonia UVic UCC, Vic, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Plitidepsin is an antitumoral compound safe for treating COVID-19 that targets the translation elongation factor eEF1A. Here we detect that plitidepsin decreases de novo cap-dependent translation of SARS-CoV-2 and non-viral RNAs but affects less than 13% of the host proteome, thus preserving cellular viability. In response to plitidepsin, cells upregulate EIF2AK3 and proteins that reduce translation, but also proteins that support proteostasis via ribosome synthesis and cap-independent translation by eIF4G2 and IGF2BP2. While plitidepsin inhibits cap- or internal ribosome entry sites (IRES)-mediated translation, its impact on N6-methyladenosine (m6A) translation is limited. In agreement, plitidepsin blocks members of Coronaviridae, Flaviviridae, Pneumoviridae and Herpesviridae families. Yet, it fails to inhibit retroviruses that exploit m6A synthesis routes and are blocked by drugs targeting IGF2BP2 m6A reader. By deciphering the molecular fingerprint of cells treated with therapies targeting translation we identify a rational approach to select broad-spectrum antivirals with potential to counteract future pandemic viruses.

Palabras clave

AdenosineAntiviral agentsC-virus-rnaCellCovid-19Covid-19 drug treatmentEef1a1 protein, humanEfficientEukaryotic initiation factor-4gHek293 cellsHost-directed therapiesHumansInhibitionInternal ribosome entry sitesPeptide elongation factor 1Peptides, cyclicPlitidepsinProtein biosynthesisReplicationRna capsSars-cov-2

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Nature Communications debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2025, se encontraba en la posición 10/135, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2025-12-14:

  • WoS: 6

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-12-14:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 17.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 18 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 30.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 13 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: http://hdl.handle.net/20.500.12327/3715

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: United States of America.

Observaciones

MICINN/Programa Estatal de I+D+I orientada a los retos de la sociedad/PID2020-117145RB-I00/ES/NUEVAS TERAPIAS ANTIVIRALES E INMUNOMODULADORAS FRENTE AL SARS-COV-2/; MICINN/Programa Estatal para impulsar la Investigación Científico-Técnica y su Transferencia/PID2023-147498OB-I00/ES/NUEVAS TERAPIAS ANTIVIRALES E INMUNOMODULADORAS DE AMPLIO ESPECTRO FRENTE A FACTORES CELULARES DEL HUESPED/; EU/H2020/101046118/EC/RBD Dimer recombinant protein vaccine against SARSCoV2/RBDCOV; MICINN/ /JDC2023-050389-I/ES/ /; MICINN/Programa Estatal para Desarrollar, Atraer y Retener Talento/RYC2021-033035-I/ES/ /; MICINN/ /PLEC2022-009171/ES/Granja in vitro: desarrollo del primer biobanco de organoides de animales de granja como alternativa a los experimentos con animales en la investigación de enfermedades infecciosas/FARMBANK

Reconocimientos ligados al ítem

N.I-U. is supported by the Spanish Ministry of Science and Innovation (grants PID2020-117145RB-I00, PID2023-147498OB-I00 and 10.13039/501100011033, Spain), EU HORIZON-HLTH-2021CORONA-01 (grant 101046118, European Union) and by institutional funding of PharmaMar, Grifols, HIPRA, and Amassence. E.M-M. is supported by the Spanish Ministry of Science and Innovation (grant PRE2021-099271). E.F-T is supported by JDC2023-050389-I funded by MCIU/AEI/10.13039/501100011033 and FSE+. E.G-V. is a research fellow from PERIS (SLT017/20/000090). E.B. and R.B. are research fellows from ISCIII-FIS (CPII19/00012; CP19/00011). K.K. is supported by funding from the Spanish Ministry of Research and Innovation (RYC2021-033035-I/AEI/10.13039/501100011033). G.C. is supported with funding from PLEC2022-009171/AEI/10.13039/501100011033. IrsiCaixa is supported by 2021 SGR 0045. The proteomic analyses were conducted at the IJC Proteomics Unit, which is affiliated with the Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) and the Spanish Platform of Molecular and Bioinformatics Resources (ProteoRed), Instituto de Salud Carlos III (PT17/0019), and CERCA GINYNS. This unit serves as a gateway to scientific and technical infrastructures. We acknowledge J. Diaz from the CMCiB for his constant help at the BSL3 facility. We thank the contribution of E. Martro and V. Saludes from the Microbiology department of HUGTIP for their constant help to identify and sequence SARS-CoV-2 variants. The authors also acknowledge the crowdfunding initiative #Yomecorono (https://www.yomecorono.com) and Foundation Dormeur for financial support for the acquisition of the QuantStudio-5 real-time PCR system and an Eclipse Ts2RFL inverted research microscope.